2010.02.26

Idag efter att vi har slutat vår sista gemensamma lektion för dagen, ringde vi Kurt för att kolla om det är möjligt att komma till KNC för att laborera någon gång under sportlovet. Vi kan alla dagar förutom tisdag och onsdag under lovet vecka 9, kom vi överenst om att kl. 9:00 på torsdag skulle vi laborera. Dagen efter, på fredag, kommer vi åka dit igen för att fotografera och dokumentera resultatet.

//Alina & Daniela

För ett tag sen fick vi ett svar från Kurt då han skrev att han inte kommer att vara på KNC varken imorgon eller på fredag. Han frågade om vi vill göra det nästa vecka istället, dvs under sportlovet. Vi kom överens om att laborera nästa vecka istället,då vi kan alla dagar förutom onsdag och tisdag. Just nu väntar vi på svar från Kurt.

//Daniela & Alina

I måndags hade vi bestämt oss för att åka till KNC, för att utföra laboration nummer 2. Men det gick inte som vi hade planerat på grund av kaoset i trafiken. Därför ringde Alina till Kurt under samma förmiddag och talade om för honom att vi inte kunde komma på grund av problemen med trafiken. Jag skickade ett mail till Kurt för att fråga om vi ska göra laborationen imorgon istället och sedan titta på resultaten på fredag. Jag har ännu inte fått något svar. Vi vill helst göra klart den praktiska delen denna vecka så att vi båda kan börja räkna och skriva på den vetenskapliga rapporten under lovet.

Nu väntar jag bara på ett svar från Kurt för att se om vi kan åka ut till KNC imorgon.

//Daniela

2010-02-16 tid: 09.00-10.45

Idag var vi på KNC för att fotografera bakterierna som vi lät växa till sig på agarplatorna, från tvätt-testet i förra veckan. De material vi använde oss utav idag var: kamera (Nikon), hållare, agarplattor och UV- ljus. Med hjälp av UV- ljuset kunde vi se bakteriekollonierna som började lyssa grönt. Eftersom på vissa agarblattor fanns det luflbublor bland bakterierna, underlättade det för oss när de lös grönt. Detta gjorde så att vi undgick misstaget att räkna ihop bakterierna med bubblorna, vilket skulle ge avvikande resultat. Bilderna som vi tog med kameran kommer vara till för att räkna kolonierna på datorn, där man kan förstora upp och lättare räkna ut antalet kolonier. Vi försökte räkna dem där på plattorna, men det blev för många kolonier och nära varandra, vilket gjorde att det var svårt att räkna dessa. Bilderna kommer Kurt senare skicka på mail, för att överföringssladden inte fanns där för tillfället.
Under tiden som vi fotograferade och tittade på de olika avtrycken, kunde vi se att på en del agarplattor fanns det inga kolonier, tomt! Fast i andra plattor kunde vi hitta enstaka kolonier och många kolonier. Det blev en väldigt konstigt resultat, då på Alinas fingeravtryck kunde det inte finnas ett enda koloni, men på Danielas fanns det flera stycke. Detta kan bero på att vi kanske kontaminerade händerna med för liten mängd bakterielösning, vilket var o,5ml. Men man kan kolla på annat sätt, där handtvättsprocessen kan ha varit effektiv mot dessa bakterier, vilket resulterar att alla/de flesta bakterierna försvinner genom de handtvätt vi gjorde.

Handtvätten vi gjorde förra veckar var ett test för oss, för att se om denna metod fungerar eller inte. Som tur var, visade det sig att det fungerar, men, att vi nu har bestämt oss för att göra om detta fast även förändra och förbättra kanske följande saker:

1. Låta bakterierna som vi överförs från händerna in till centrifugurören växa i 37 grader i ca 2-4 timmar. Sedan kan dessa studeras för att se om näringsämnet har blivit grumligt eller inte. Vanlig näringsämne är genomskinlig, men när bakterierna förökar sig och blir fler, blir lösningen grumligare. Om det inte blir grumligt måste man låta det växa över natten (12h), för att senare kunna studera om det blev någon skillnad. Detta kommer vi då att fotografera.

2. Öka koncentrationen av bakterier samt lägga mer halt av bakterielösningen på händerna, t ex 1ml istället för 0,5ml.

Efter att vi hade fotograferat agarplattorna tejpade vi runt dessa med parafilm (laboratory film) en speciellt tejpaktig material, av vax, för att bakteriena inte ska torka ut i plattorna. Eftersom vi kanske kommer behöva titta på dessa ännu en gång lite senare, kan det vara bra att spara dessa.

Vi passade även på att ha ett litet möte på saltsjöbanan på väg till skolan, då vi kom överens om att vi redan nu kan börja med att kolla hur man ska skriva en vetenskaplig rapport. Vi kommer att ha de engelska rapporterna vi fick skickade från Kurt, som mallar. Var och en av oss kommer att ansvara för följande:

Alina
-Bakgrund
-Inledning
-Syfte

Daniela
- Resultat (resultat från testdelen)
- Metod (metod för testdelen)
- Material
- Felkällor ( felkällor från testdelen)

Dessa 7 punkter kan vi skriva om nu, resterande (6) punkter kommer vi att skriva om när vi är klara med allt. Med dessa 7 punkter kommer vi påbörja skriva på redan nu, så att vi kan hinna lämna in ett utkast senast vecka 13.
Detta ska göras nästa vecka:

• Laboration 2 på KNC- Måndag
• Fotografering av resultat från laboration- Torsdag
• Ska ha påbörjat skrivandet i rapport
• Börja med beräkningar av resultat
• Vilka är E. Colibakterier? Läsa om dessa och få svar!

//Alina & Daniela

Projektarbete 2010-02-15 Tid: 15.10-16.30

Idag hade vi ännu en gång samlats för att ha delseminarium 3, antagligen den sista. Senaste gången vi hade delseminarium, var under vecka 49 och 50. Sen dess har vi arbetat vidare med vårt projekt för att komma igång med så mycket som möjligt inför delseminarium 3. Under seminariumet samlades vi med andra elever för att presentera vad man själv har för ett slags projekt, för dem som inte visste det tidigare. Man skulle även berätta lite kring vad projektet går ut på, svårigheter, samt hur långt man har kommit och vad nästa steg är eller blir. Efter att Daniela och jag hade berättat vår del, så ställdes det lite frågor som exempelvis: om bakterierna vi arbetade med var farliga, vilken slutprodukt vi kommer att göra etc.

Det som har vart bra med dessa seminarier är att man även har fått lite hjälp från idéerna som andra elever gav, även lite hjälp om hur man kan göra med en viss metod vi har förklarat. Under delseminarium 2 fick Dannie en idée från en elev att man även skulle kunna testa använda hälsosjukvårdstvål, istället för att bara testa vanligt flyttande tvål och kaktvål. Detta tyckte vi lät bra, då vi diskuterade fram om tvål som finns på sjukhus är bättre än de som "vanliga" människor köper. Detta använde vi oss utav i vår tvättningsprocess.

Det var också spännande att lyssna på alla andras idéer om hur de har tänkt och vilken slags metod samt slutproduktion de kommer att ha. Vid dessa tillfällen övar man även till den muntliga presentationen som kommer att ske inför andra elever om några veckor, som också är ett stort plus! :)

// Daniela & Alina

2010.02.13

Igår skickade Daniela och jag ett mail till David angående del 2 av vårat praktiska del, då vi inte kunde prata med honom för han är sjuk. På tisdag eller onsdag under den veckan som kommer, måste vi räkna kolonier och se samt dokumentera resultatet. Båda av dessa dagar har vi lektioner, dessutom ett prov i kemi på tisdag. Kurt sade att det inte kommer att ta lika långt tid som första gången, men jag skickade ett mail där jag undrade ungefär hur långt tid det kommer att ta, så vi hinner till provet på eftermiddag. Svar kommer.
Om det visar sig att det finns en risk att vi inte hinner, kommer vi då vara berädda att offra kemilektionen på onsdag till projektarbetet.

Nu väntar vi på svar, för att bestämma något mer konkret.

//Alina

projektarbete 2010-02-11 tid: 9.00-14.00

Idag var vi på KNC för att utföra vårt första praktiska del. Vi hade bestämt oss för att vi skulle börja klockan 9.00 och arbeta fram till ca 17.00. Innan vi började med experimentet gjorde vi en förberedelse som ett slags process för vad vi ska göra idag, och hur vi ska gå till väga. Till vår stora lycka hade Berndt förberett en bakterielösning dagen innan vi skulle laborera, det var bra för vi var så oroliga att vi inte skulle klara av att göra det själva. Han hade 3 plaströr med sig där den ena av dessa var fylld med bakterier i ett näringsämne, och de två andra var bara fyllda med ren näringsämne. Dessa var 50 ml vardera. Sen hällde Kurt ut en av rören i en E-kolv, 50 ml ren näringämne som innehöll LB och amp, ampeselin, 100 mg/ml, och tillsatte 1 ml av bakterielösningen. Denna E-kolv med den nya bakterielösningen ställde han in i en inkubator som var inställd på 37 grader, för att låta dessa bakterier växa. Klockan 10.00 ställde vi in lösningen i incubatorn och lät den stå där i minst två timmar, ungefär då vi kom tillbaka efter lunch.
Detta är vår mall som vi ritade upp på tavlan och använde oss utav.

1. Vi formar 20 stycken glasplatinöser med hjälp av bränare till en trekant ungefär, fast många av våra rör blev inte så fina som Kurts. Men många snygga lyckades vi skapa i alla fall. Här på bilden syns en av dessa.

2. Under tiden bakterierna står i inkubatorn, fick vi lära oss att använda speciella pipetter. Vi fick förklarat för oss att inom kemin är det vanligt att använda sig utav mycket små mängder av ämnen. Det är vanligast att använda sig utav mängder under 1000 mikroliter (1ml). Och dessa pippeter är anpassade på så sätt att de får bort vartenda droppe så att inget är kvar i pipetten. Riktigt bra!Det fanns tre pippeter 0.5-10, 10-100 och 100-1000 mikroliter, men vi använde oss utav två av dessa.

3. Vi tillsätter 0,5 ml av näringsämne i 16 små centrifigurrör. 2 av dessa är reserv, ifall man skulle göra något fel.

4. Vi gör ett protokol för handtvättning som ser ut på följande sett:
a) Börja med att tvätta händerna med vanligt flyttande tvål för att ha rena händer innan experimentet. Torka händerna.
b) 0,5 ml av bakterielösning, från unkubatorn, tillsätts på handflattorna och knids mot varandra. Låt torka i 2 min.
c) Kontroll: tummavtryck, och med centrifugurrör. Centrifiguröret med näringsämnet, använder vi genom att lägga den på en viss yta på handflatan och vända den upp och ned tre gånger för att bakterierna som finns på händerna, hamnar i näringsämnet.

5. Genomförande
a) Tillsätt 0,5 ml av bakterielösning på händerna, låt torka i 2 min. Efter detta görs avtryck på agarplatta.
b) Tvätta händerna med tvål i 15 sek (Alina) eller 3min (Daniela) och låt torka i 2 min. Efter detta görs avtryck på agarplatta respektive centrifigurör.
c) Tillsätt desinfektionsmedel och låt torka i 1 min. Gör avtryck respektive centrifigurör.

Vi gjorde genomförandet enligt denna mall varje gång vi använde oss av olika tvålar, ungefär 6ggr.

6. Vi tar 50 mikroliter (0,05) av näringen i centrifigurrören, innehållande våra bakterier, med pipetter och droppar på en agarplatta. Det är nu vi använder oss utav glasplatinöserna som vi formade innan, för att stryka igenom droppen över ett visst område.

7. Ställ agarplattorna i inkubatorn på 37 grader för att låta kolonier växa till nästa gång. Berndt kommer att titta till dem imorgon för att ställa dem i kylen (4 grader) om de har växt, så att vi kan undersöka dessa nästa gång.

Eftersom vi använde oss utav många agarplattor och små rör hela tiden var det viktigt att inte blanda ihop dessa. Därför markerade vi dessa med små koder för att underlätta processen. Vi markerade plattorna med följande koder:
A- Alina
D - Daniela
DF- desinfektionsmedel
C- kontroll över bakterier
T1- kaktvål
T2- vanligt flyttande tvål
T3- hälsosjukvårdstvål

Vårt nästa steg är att räkna kolonierna på agarplattorna nästa vecka, helst tisdag. Vi ska fotografera och lyssa med UV- ljus på bakterierna.

• Prata med Eva om hjälp till vår slutprodukt (broschyr)
• Vi måste prata med David om det är möjligt att göra detta under vår lektionspass.
• Skicka mail till kurt angående nästa vecka

// Alina & Daniela

projektarbete 2010-02-08 tid: 15.30-16.00

Sent under eftermiddagen igår fick jag och Alina ett mail från Göran Hedin, överkläkare som arbetar i Dalarna. Han bad oss att ringa honom för att det är mycket lättare att prata i telefon än att maila till varandra. Medan jag ringde upp Göran, skickade Alina ett mail till Lotta och David angående laborationen på torsdag. Hon bad dem att prata med våra respekvite språklärare, om att vi kanske inte skulle komma till språkpasset. I detta fall måste projektarbetet gå före språklektionen, eftersom vi inte ännu har satt igång med vårt experiment samt att tiden gårt fort fram.

Under mitt samtal med Göran diskuterade vi kring metoder, för vår skull antecknade jag allt han sa för att det skulle underlätta för oss. Han nämnde att det är ont om tid att utföra experimentet utifrån en mall som EU har använt och det beror på följande saker:

1. Det krävs en bred kunskap om bakterier.
2. Man måste vara vann vid att laborera med bakterier och ha kunskap om avancerad laboration.
3. Mallen för metoden finns att köpa på standarliseringsinstitutet (SSI) för 500-600 kr, och det är 40-50 sidor långt. Det tar jättelång tid att läsa igenom detta, och Hedin nämnde även att det inte är lätt att arbeta utifrån denna mall eftersom den inte ligger på gymnasienivå.

Göran påstod också att det är Kurt Berndts uppgift att ta fram en metod vilken vi kan arbeta utifrån, eftersom vi inte är kapabla att hitta på en metod på egen hand.

Men vi har fortfarande hopp eftersom han gav ett mycket bättre förslag som lät mycket enklare för oss att genomföra. Förslaget var att vi utifrån handledarens hjälp ska förbereda en bakterielösning med koncentrationen av 10^5 bakterier/ml som vi ska låta växa i ett dygn. När detta har växt klart så kan man sedan börja med handvätt testen med de olika tvålarna och desinfektionsmedel. Detta test kan vi göra genom att vi använder oss av våra fingertoppar, då vi duttar ner dessa i bakterielösningen och sedan gör ett avtryck på en agarplatta. Därefter tvättar vi händerna med exempelvis hälsosjukvårds tvål och gör ett avtryck av det. Sen fortsätter man och gör på samma sätt men att man använder de andra typer av tvålar samt desinfektionsmedel. Man kan säga att vi följer samma mall som Alina och jag gjorde innan jullovet, som man kan se här nere.


















Det viktigaste i detta fall är att vi inte har så stor mängd av bakterier, vilket man måste undvika. Om man har en koncentration som överstiger 10^5 bakterier/ml, så kommer resultatet inte vara så bra efter handtvättning, för då försvinner inte lika mycket bakterier. Man måste även mäta koncentrationen man har från början, och även titta på hur mycket som har förminskats efter varje handtvätt.

Nästa steg

• Experiment på tordag: kl 9.00-ca 17.00 på KNC
• Medtag: kamera, tvålar, desinfektionsmedel, handskar, block, penna, sud.

//Alina och Daniela

2010-02-08

Förra veckan hittade jag ett gammalt mail från en forskare vid namn Göran Hedin som arbetar i Dalarna. Vi skickade mail till honom och frågade kring vilken metod man kan använda sig utav, för att förbereda en bakterielösning. Han förklarade på följande sätt:

Det beror på vilken volym av bakteriesuspension du vill ha. Om ett provrör räcker så kan du ta några bakterie-kolonier från en agarplatta och slamma upp i en koksaltlösning i provröret. Man brukar använda en s k McFarlandskala för att med hjälp av grumligheten i röret uppskatta mängden bakterier / ml. McFarland 0.5 motsvarar cirka 10 000 000 cfu/ml. Om man vill veta exakt antal cfu måste man göra en spädningsserie 1:10 av baktsuspensionen i koksaltlösning och odla ut från varje spädning på agar för att räkna kolonierna.

Om du behöver större volym så är det lämpligast att odla bakterier ett dygn i en näringsbuljong där de får tillväxa. Det brukar resultera i bakteriekoncentrationer på ca 100 000 000 – 1000 000 000 cfu/ml. Kan spädas vid behov. För att ta reda på exakt mängd bakterier / ml får man även här göra en viable count.

/Göran Hedin

Eftersom vi inte riktigt förstod vad han menade bestämde vi oss för att gå vidare och söka efter hjälp någon annanstans, men det gick inte heller så bra med tanke på att handhygiensjuksköterskan inte kunde ge ut den skriftliga metoden. Därför valde vi att återgå till detta mail och frågade ännu en gång om metoden. Vi fick svar och var tvungna att vidarbefodra det till vår handledare Kurt Bernd, och gav Göran Hedin Berndts nummer samt e- mail eftersom Hedin ville ta kontakt med honom. Både Göran och Kurt pratade med varandra kring metoden och det var viktigt att Kurt fick informationen eftersom han är vår handledare och ansvarar för det vi kommer att experimentera med.

Idag fick vi mail från Kurt då han skrev följande:
Hi:
I got a phone call from a medical doctor in Dalarna. He said he sent you both some information. He had a protocol for testing hand washing protocols.Can you come Thursday this week?

Kurt

Vi har bestämt oss för att vi ska börja med vårt experiment nu på torsdag, eftersom tiden går fort och vi måste sätta igång. Vi behöver en hel dag på oss för att förbereda bakterielösningen och vi måste sätta igång denna vecka, vi har haft en tendens att skjuta på det beroende på att vi inte riktigt har fått en klar metod. Vi kommer börja vårt experiment klockan 9:00 och sluta runt klockan 17:00. På fredag kommer vi återigen att åka till saltsjöbaden för att anteckna, räkna bakteriekulturen börja med våra handtvätt test samt fotografera våra resultat.


// Daniela & Alina

2010-02-01

Idag ringde vi till Gerd, hygiensköterskan, angående metoden som vi skulle få. Men nu sade hon att vi inte kan få det, eftersom det är någon säkerhetsrisk, antagligen är metoden klasificierad. Hon gav oss ett namn på en överläkare - Måns Ullberg, som Kurt behöver ta kontakt med för att vi ska kunna få tillgång till metoden.

Vi skickade ett mail till Kurt, där vi bad honom att ta kontakt med Ullberg. Nu vet vi inte om det är möjligt för oss att använda den metoden, så Daniela och jag kommer leta eter andra möjliga metoder inann lördagen.

//Alina&Daniela